目前美国在日本有５０多个专用军事基地及设施，驻有约５万名士兵。其中比较重要的军事基地有：

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　陆军：座间兵营，位于东京西南４０公里处，是驻日陆军司令部所在地和陆军第９战区陆军区域司令部所在地，２００７年１２月美陆军第１军在这里设立新司令部。

　　海军：横须贺基地，位于东京西南５０公里神奈川县东京湾畔，是美海军第７舰队司令部驻地和“乔治·华盛顿”号航母战斗群的母港。佐世保基地，位于九州岛西北角，是美两栖舰艇部队的常驻地和攻击型两栖舰队的出击基地，也是美军前沿部署部队的主要后勤保障基地。

　　海军陆战队：岩国基地，位于本州岛最南端，是陆战队第３远征部队主力航空部队的驻地。冲绳的巴特勒陆战队营地驻有陆战队第３远征部队（含第１航空联队、第３陆战师和第３勤务支援大队）和驻冲绳舰队司令部。冲绳的普天间机场是美海军陆战队在日本最大规模的武装直升机机场，位于普天间市中心，因周边居民一直对基地带来的噪声、事故、美军犯罪等问题多有不满，２００６年日美达成协议，同意将普天间基地转移至位于冲绳县名护市的施瓦布军营沿岸地区。

　　空军：横田基地，这里没有作战机群，是美国空军和其他部队进行联络的中心和军事空运司令部的所在地，也是驻日美军司令部的驻地。

　　

　　

　　冲绳嘉手纳空军基地，位于冲绳岛西南部，面积近２０平方公里，是美国本土以外最大的具有快速反应能力的空军基地，也是美国宇航局指定的航天飞机紧急着陆场，驻有美空军第５航空队第１８航空联队、空军第３９０情报中队、第８２侦察机中队和３５３特种作战大队等部队。

　　三泽基地：位于东京东北６４４公里，驻有美空军第３５战斗机联队和海军海上巡逻机中队，美国空军第６９２０电子保安团、海军的通信保安团、海军陆战队的支援团Ｅ连和陆军第５００军事谍报团也部署在这里。由于三泽基地内美国四军谍报部队齐聚，通信、电子谍报等机密活动集中，因而也被称作美国设在太平洋东岸的谍报站。

　　在日本的“美国太君”：

　　

　　黑白部分：

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　   

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　

　　彩色部分：